Chef du service:
Situation du service :
Service Microbiologie et hygiène hospitalière
Carémeau Sud
Hall 5 Niveau 0
Hôpital Universitaire Carémeau
Place du Pr. Robert Debré
30029 Nîmes Cédex 9
Prendre rendez-vous
Spécialiste de la Brucella, la bactérie à l’origine de cette maladie infectieuse, le service de Microbiologie du CHU de Nîmes a été labellisé Centre national de référence (CNR)-Laboratoire expert.
Nous y assurons le diagnostic direct (bactériologique et, le cas échéant moléculaire) de la maladie (détection, recherche, identification et typage des souches de Brucella), l’expertise épidémiologique, le diagnostic indirect (immunosérologique) et l’expertise clinique.
Documents utiles
Les missions qui nous sont dévolues en tant que CNR
Apporter une expertise microbiologique :
- contribuer au développement de nouvelles techniques diagnostiques, à leur évaluation et à leur diffusion,
- apporter son expertise aux laboratoires de biologie médicale pour le diagnostic des brucelloses (isolement, détermination de l’espèce, confirmation du diagnostic sérologique),
- collaborer avec des laboratoires experts en santé animale (échange d’informations, échanges de souches, comparaison des caractéristiques des souches d’origine humaine, alimentaire et animale, développement d’études en commun, etc.).
Contribuer à la surveillance épidémiologique en lien avec Santé Publique France :
- en développant un réseau de laboratoires collaborateurs sur l’ensemble du territoire,
- en signalant à Santé Publique France les cas identifiés au CNR,
- en contribuant à l’investigation des cas groupés,
- en collaborant avec les réseaux de surveillance internationaux et en particulier européens notamment dans le cadre de l’application de la directive zoonoses 2003/99/CE.
Contribuer à l’alerte en signalant à Santé Publique France tout événement inhabituel :
- augmentation du nombre de cas,
- apparition de cas groupés,
- modification des formes cliniques (répartition, modification de leur expression clinique, formes inhabituelles),
- introduction de souches habituellement non présentes en France, etc.
Contribuer aux travaux du réseau national des laboratoires Biotox :
- apporter son expertise spécifique au service des instances concernées de santé publique, de défense et de sécurité nationale
- contribuer avec les instances chargées de leur pilotage, à l’animation du réseau des laboratoires Biotox
- contribuer à la mise en place d’une collection nationale de souches des agents de la menace pour les besoins de la biodefense.
Organigramme du CNR
LAVIGNE Jean-Philippe
SOTTO Albert
O'Callaghan David
KERIEL Anne
PASTRE Théo
Contacter le CNR Brucella
Pr J-P. LAVIGNE (CHU de nîmes, Service de Microbiologie)
04 66 68 32 02
Dr David O'Callaghan (VBIC, INSERM U1047)
04 66 02 81 46
Microbiologie et hygiène hospitalière
04 66 68 32 02 cnr.brucella@chu-nimes.frNos activités
Réalisation de prélèvements :
Le diagnostic de certitude de la brucellose demeure fondé sur l’isolement en culture des Brucella par la réalisation d’hémocultures aérobies nécessitant plusieurs jours d’incubation des cultures. Lorsque les cultures sont négatives ou non réalisées, un prélèvement sanguin permet d’effectuer les sérologies pour confirmer un diagnostic.
Sachez que l'’isolement des Brucella nécessite des conditions de culture et de sécurité particulières pour éviter la transmission par voie respiratoire ou transconjonctivale de la maladie chez le personnel de laboratoire. Ces cultures doivent être réalisées en laboratoire de sécurité biologique de niveau 3 (NSB3).
Il est important de noter que les prélèvements doivent être réalisés avant tout traitement antibiotique et le transport des prélèvements vers le laboratoire doit être rapide.
Identification des espèces :
- par examen direct avec la coloration de Gram
- en milieux de culture nécessitant un certain temps d’incubation
- diagnostic d'espèces par isolement d’une souche bactérienne et méthodes phénotypiques
- classification des espèces par outils de biologies moléculaire
- diagnostic génomique par amplification génique
- diagnostic protéique par spectrométrie de masse
- étude de la sensibilité aux antibiotiques
PCR : Polymerase chain reaction / réaction en chaîne par polymérase
La réaction en chaîne par polymérase (PCR) est une technique clé dans le diagnostic de la brucellose, notamment lorsque l’administration d’une antibiothérapie empêche l’isolement de Brucella. Elle permet d’amplifier l’ADN bactérien à partir de divers prélèvements (sang, biopsies, liquide céphalorachidien…). Plus rapide que l’hémoculture, elle offre une sensibilité variable selon les méthodes utilisées.
La PCR limite aussi le risque d’infection pour le personnel de laboratoire. Toutefois, sa fiabilité peut être affectée par des inhibiteurs ou des contaminations. Des techniques avancées, comme la PCR multiplex, permettent d’identifier précisément les espèces de Brucella, mais restent principalement du ressort des laboratoires spécialisés.
Sérologie
- la technique d’agglutination en tube ou séroagglutination de Wright (SAW)
- la technique d’agglutination sur lame ou épreuve de l’antigène tamponné (EAT) (ou test au Rose Bengale)
- la technique d'immunocapture Brucellacapt
- détection IgM et IgG par ELISA
Comment envoyer des souches ou sérum au CNR ?
Tout envoi de souches nécessite de contacter impérativement le CNR soit par e-mail, soit par téléphone au préalable.
- Compléter et envoyer la fiche de demande d'analyses dans le colis (à l'extérieur)
- Respecter les conditions préanalytiques des échantillons
- Préférer un envoi le lundi
Consultez le PDF récapitulatif de la procédure :
Publications et bilan d'activité
Stahl JP, Bru JP, Gehanno JF, Herrmann JL, Castan B, Deffontaines G, Sotto A, Lepelletier D, Tattevin P, Godefroy N, Haddad E, Mailles A, Lavigne JP.
"Guidelines for the management of accidental exposure to Brucella in a country with no case of brucellosis in ruminant animals."
Med Mal Infect. 2020 Sep;50(6):480-485. doi: 10.1016/j.medmal.2020.05.002. Epub 2020 May 19.
PMID: 32442670
Rouzic N, Desmier L, Cariou ME, Gay E, Foster JT, Williamson CHD, Schmitt F, Le Henaff M, Le Coz A, Lorléac'h A, Lavigne JP, O'Callaghan D, Keriel A.
"First case of brucellosis caused by an amphibian-type Brucella."
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PMID: 32719850
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PMID: 32703319
Jiang H, O'Callaghan D, Ding JB.
"Brucellosis in China: history, progress and challenge."
Infect Dis Poverty. 2020 May 24;9(1):55. doi: 10.1186/s40249-020-00673-8.
PMID: 32448394
García-Méndez KB, Hielpos SM, Soler-Llorens PF, Arce-Gorvel V, Hale C, Gorvel JP, O'Callaghan D, Keriel A.
"Infection by Brucella melitensis or Brucella papionis modifies essential physiological functions of human trophoblasts."
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PMID: 30817085
Holzapfel M, Girault G, Keriel A, Ponsart C, O'Callaghan D, Mick V.
"Comparative Genomics and in vitro Infection of Field Clonal Isolates of Brucella melitensis Biovar 3 Did Not Identify Signature of Host Adaptation."
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PMID: 30405566 Free PMC article.
Mesureur J, Arend S, Cellière B, Courault P, Cotte-Pattat PJ, Totty H, Deol P, Mick V, Girard V, Touchberry J, Burrowes V, Lavigne JP, O'Callaghan D, Monnin V, Keriel A.
"A MALDI-TOF MS database with broad genus coverage for species-level identification of Brucella."
PLoS Negl Trop Dis. 2018 Oct 18;12(10):e0006874. doi: 10.1371/journal.pntd.0006874. eCollection 2018 Oct.
PMID: 30335748
Mailles A, Ogielska M, Kemiche F, Garin-Bastuji B, Brieu N, Burnusus Z, Creuwels A, Danjean MP, Guiet P, Nasser V, Tourrand B, Valour F, Maurin M, O'Callaghan D, Mick V, Vaillant V, Jay M, Lavigne JP, DE Valk H.
"Brucella suis biovar 2 infection in humans in France: emerging infection or better recognition?"
Epidemiol Infect. 2017 Oct;145(13):2711-2716. doi: 10.1017/S0950268817001704. Epub 2017 Aug 8.
PMID: 28784192
Blanc-Gruyelle AL, Lemaire X, Guaguere A, Sotto A, Senneville E, Lavigne JP.
"An atypical presentation of human brucellosis."
Med Mal Infect. 2017 Mar;47(2):164-166. doi: 10.1016/j.medmal.2016.10.006. Epub 2016 Nov 15.
PMID: 27863930
Soler-Lloréns PF, Quance CR, Lawhon SD, Stuber TP, Edwards JF, Ficht TA, Robbe-Austerman S, O'Callaghan D, Keriel A.
"A Brucella spp. Isolate from a Pac-Man Frog (Ceratophrys ornata) Reveals Characteristics Departing from Classical Brucellae."
Front Cell Infect Microbiol. 2016 Sep 28;6:116. doi: 10.3389/fcimb.2016.00116. eCollection 2016.
PMID: 27734009 Free PMC article.
Mailles A, Garin-Bastuji B, Lavigne JP, Jay M, Sotto A, Maurin M, Pelloux I, O'Callaghan D, Mick V, Vaillant V, De Valk H.
"Human brucellosis in France in the 21st century: Results from national surveillance 2004-2013."
Med Mal Infect. 2016 Dec;46(8):411-418. doi: 10.1016/j.medmal.2016.08.007. Epub 2016 Oct 4.
PMID: 27717526
Mesureur J, Ranaldi S, Monnin V, Girard V, Arend S, Welker M, O'Callaghan D, Lavigne JP, Keriel A.
"A Simple and Safe Protocol for Preparing Brucella Samples for Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry Analysis."
J Clin Microbiol. 2016 Feb;54(2):449-52. doi: 10.1128/JCM.02730-15. Epub 2015 Nov 18.
PMID: 26582837
Saadeh B, Caswell CC, Chao Y, Berta P, Wattam AR, Roop RM 2nd, O'Callaghan D.
"Transcriptome-Wide Identification of Hfq-Associated RNAs in Brucella suis by Deep Sequencing."
J Bacteriol. 2015 Nov 9;198(3):427-35. doi: 10.1128/JB.00711-15. Print 2016 Feb 1.
PMID: 26553849
Mailles A, Rautureau S, Le Horgne JM, Poignet-Leroux B, d'Arnoux C, Dennetière G, Faure M, Lavigne JP, Bru JP, Garin-Bastuji B.
"Re-emergence of brucellosis in cattle in France and risk for human health."
Euro Surveill. 2012 Jul 26;17(30):20227.
PMID: 22856510
Loubet P, Magnan C, Salipante F, Pastre T, Keriel A, O'Callaghan D, Sotto A, Lavigne JP.
Diagnosis of brucellosis: Combining tests to improve performance.
PLoS Negl Trop Dis. 2024 Sep 5;18(9):e0012442.
Melzani A, Boutrou M, Sainte-Rose V, About F, Douine M, Michaud C, Nacher M, Gaillet M, Blanchet D, Lavigne JP, Demar M, O'Callaghan D, Djossou F, Keriel A, Epelboin L.
Case Report: Acute Brucellosis Due to Brucella suis in a Brazilian Gold Miner Diagnosed in French Guiana.
Am J Trop Med Hyg. 2023 May 30;109(1):32-34.
About F, Pastre T, Boutrou M, Martinez AY, Melzani A, Peugny S, Michaud C, Zouaoui S, Carage T, Rose VS, Demar M, Lavigne JP, Djossou F, O'Callaghan D, Epelboin L, Keriel A.
Novel Species of Brucella Causing Human Brucellosis, French Guiana.
Emerg Infect Dis. 2023 Feb;29(2):333-340.
Rouzic N, Desmier L, Cariou ME, Gay E, Foster JT, Williamson CHD, Schmitt F, Le Henaff M, Le Coz A, Lorléac'h A, Lavigne JP, O'Callaghan D, Keriel A.
First Case of Brucellosis Caused by an Amphibian-type Brucella.
Clin Infect Dis. 2021 May 4;72(9):e404-e407.
Moreno E, Middlebrook EA, Altamirano-Silva P, Al Dahouk S, Araj GF, Arce-Gorvel V, Arenas-Gamboa Á, Ariza J, Barquero-Calvo E, Battelli G, Bertu WJ, Blasco JM, Bosilkovski M, Cadmus S, Caswell CC, Celli J, Chacón-Díaz C, Chaves-Olarte E, Comerci DJ, Conde-Álvarez R, Cook E, Cravero S, Dadar M, De Boelle X, De Massis F, Díaz R, Escobar GI, Fernández-Lago L, Ficht TA, Foster JT, Garin-Bastuji B, Godfroid J, Gorvel JP, Güler L, Erdenliğ-Gürbilek S, Gusi AM, Guzmán-Verri C, Hai J, Hernández-Mora G, Iriarte M, Jacob NR, Keriel A, Khames M, Köhler S, Letesson JJ, Loperena-Barber M, López-Goñi I, McGiven J, Melzer F, Mora-Cartin R, Moran-Gilad J, Muñoz PM, Neubauer H, O'Callaghan D, Ocholi R, Oñate Á, Pandey P, Pappas G, Pembroke JT, Roop M, Ruiz-Villalonos N, Ryan MP, Salcedo SP, Salvador-Bescós M, Sangari FJ, de Lima Santos R, Seimenis A, Splitter G, Suárez-Esquivel M, Tabbaa D, Trangoni MD, Tsolis RM, Vizcaíno N, Wareth G, Welburn SC, Whatmore A, Zúñiga-Ripa A, Moriyón I.
If You're Not Confused, You're Not Paying Attention: Ochrobactrum Is Not Brucella.
J Clin Microbiol. 2023 Aug 23;61(8):e0043823.
Vection S, O'Callaghan D, Keriel A.
CD98hc in host-pathogen interactions: roles of the multifunctional host protein during infections.
FEMS Microbiol Rev. 2022 Sep 2;46(5):fuac023.
Janke NR, Williamson CHD, Drees KP, Suárez-Esquivel M, Allen AR, Ladner JT, Quance CR, Robbe-Austerman S, O'Callaghan D, Whatmore AM, Foster JT.
Global phylogenomic diversity of Brucella abortus: spread of a dominant lineage.
Front Microbiol. 2023 Nov 29;14:1287046.
Pereira CR, Neia RC, Silva SB, Williamson CHD, Gillece JD, O'Callaghan D, Foster JT, Oliveira IRC, Bueno Filho JSS, Lage AP, Azevedo VAC, Dorneles EMS.
Comparison of Brucella abortus population structure based on genotyping methods with different levels of resolution.
J Microbiol Methods. 2023 Aug;211:106772.
Riquelme E, Omarova S, Ize B, O'Callaghan D.
Analysis of the Brucella suis Twin Arginine Translocation System and Its Substrates Shows That It Is Essential for Viability.
Infect Immun. 2023 Jan 24;91(1):e0045922.
O'Callaghan D.
Human brucellosis: recent advances and future challenges.
Infect Dis Poverty. 2020 Jul 23;9(1):101.
Laboratoire National de Référence
Le CNR des Brucella travaille en étroite collaboration avec le Laboratoire Nationale de Référence pour les brucelloses animales, Laboratoire de Santé Animale de Maisons-Alfort de l' Agence Nationale de Sécurité Sanitaire Alimentation, Environnement, Travail (ANSES) : échange d'informations, échange de souches, comparaison des caractéristiques des souches d'origine humaine, alimentaire et animale, études épidémiologiques en commun .
Contact :
14, rue Pierre et Marie Curie, 94706 Maisons-Alfort cedex
Tél : +33 1 49 77 13 00
Directeur : Claire Ponsart
Tél : +33 1 49 77 13 23
Vers le site du Laboratoire National de référencec